besmarts.codecs namespace

Submodules

• besmarts.codecs.codec_rdkit module
  • get_indices()
  • get_tags()
  • graph_codec_rdkit
    • graph_codec_rdkit.list_implemented_atom_primitives()
    • graph_codec_rdkit.list_implemented_bond_primitives()
    • graph_codec_rdkit.rdmol_decode()
    • graph_codec_rdkit.sdf_decode()
    • graph_codec_rdkit.smarts_decode()
    • graph_codec_rdkit.smiles_decode()
    • graph_codec_rdkit.xyz_decode()
  • list_atom_primitives()
  • list_bond_primitives()
  • parse_atom()
  • parse_bond()
  • parse_chem()
  • primitive_codec_aromatic_rdkit
    • primitive_codec_aromatic_rdkit.decode_smiles()
  • primitive_codec_bond_order_rdkit
    • primitive_codec_bond_order_rdkit.decode_smiles()
  • primitive_codec_bond_ring_rdkit
    • primitive_codec_bond_ring_rdkit.decode_smiles()
  • primitive_codec_chirality_rdkit
    • primitive_codec_chirality_rdkit.decode_smiles()
  • primitive_codec_connectivity_ring_rdkit
    • primitive_codec_connectivity_ring_rdkit.decode_smiles()
  • primitive_codec_connectivity_total_rdkit
    • primitive_codec_connectivity_total_rdkit.decode_smiles()
  • primitive_codec_element_rdkit
    • primitive_codec_element_rdkit.decode_smiles()
  • primitive_codec_formal_charge_rdkit
    • primitive_codec_formal_charge_rdkit.decode_smiles()
  • primitive_codec_hydrogen_rdkit
    • primitive_codec_hydrogen_rdkit.decode_smiles()
  • primitive_codec_ring_smallest_rdkit
    • primitive_codec_ring_smallest_rdkit.decode_smiles()
  • primitive_codec_valence_rdkit
    • primitive_codec_valence_rdkit.decode_smiles()
  • primitive_codecs_get()
  • rdkit_mol_decode()
  • rdkit_sdf_to_smiles_assignment()
  • rdkit_smarts_decode()
  • rdkit_smiles_decode()
  • rdkit_xyz_to_smiles_assignment()